纳豆中的纳豆激酶是直接分解血栓的纤维蛋白酶。具有强大的溶栓作用，比尿激酶的能力还要强，每克湿纳豆溶栓效果相当于尿激酶 1600FU ，在胃肠中不失活。纳豆激酶对血栓的作用时间长，与尿激酶 3 ～ 5 分钟作用时间相比，纳豆激酶作用长达 8小时，而且安全、无副作用。食用纳豆后，测定血液中形成血栓的物质会慢慢减少，溶解血栓的物质会越来越多，达到动态平衡。常吃纳豆还会将毛细血管中的血栓溶解掉，有效改善微循环障碍。 人体实验结果发现纳豆激酶有以下作用： （１）缩短血栓溶解时间 （２）增加血栓溶解面积 （３）增加血栓溶解产物
纳豆激酶能够专一溶解血栓，对纤维蛋白原没有降解活性，大量使用不会引起出血,可以预防和辅助治疗以下病症：脑血栓、脑梗塞、心肌梗塞、血栓后遗症、血栓静脉炎、脉管炎等。服用纳豆激酶后，血中优球蛋白溶解时间（ELT）显著延长，纤维蛋白（原）降解产物(FDP)和组织型纤溶酶原激活因子(TPA)明显增加。在急性心肌梗塞患者抢救过程中，采用静脉滴注纳豆激酶，可以迅速溶解血栓，基本没有出血危险性。纳豆激酶经静脉滴注直接进入血液循环，或口服后经肠道吸收进入血液循环来直接作用血栓，还可以诱导肝脏或血管内皮产生TPA（纳豆激酶本身无TPA抗原性），使生物体自身纤溶酶系统活化，从而温和、持续地提高血液的纤溶活性，与其它纤溶酶相比,其安全性最高。